В Новосибирске ученые обсудят проблемы "цифрового фундамента" научной и клинической медицины

Мы продолжаем знакомить вас с темами, которые будут обсуждаться на  международной мультиконференции BGRS\SB’2018 в Новосибирске 20-25 августа 2018 года.

 


Сегодня практически все технологии, которые используются и в исследовательской биологии и клинической медицине опираются на компьютерную обработку и анализ данных. Мощность исследовательского оборудования и систем мониторинга растет в геометрической прогрессии. И вместе с ней растет объем получаемой исследователем информации.

 

Еще несколько десятилетий назад первичным результатом МРТ исследования  головного мозга был пакет файлов в сто килобайт и меньше, то сейчас для того, чтобы записать полный протокол такого исследования нужно иметь десятки гигабайт памяти на DVD-диске. Рутинными материалами для исследователей стали видеоконтроль за подопытными животными, цветные микрофотографии с высоким разрешением, работа с цветовыми маркерами, видео-файлами.

 

А в совокупности получается гигантский массив информации об объекте исследования, который с полным правом можно отнести к Big data.

 

"Но сейчас, когда на нас накатывается такой огромный объем данных, остро встает вопрос, как эту информацию быстро обрабатывать, корректно анализировать и потом синтезировать полученные данные в объективный результат", - отметил заместитель директора Института цитологии и генетики СО РАН, доктор медицинских наук Андрей Летягин.

 

Ученые признают, часто речь идет об информационных массивах, проанализировать которые в разумные сроки не под силу даже самому квалифицированному специалисту, требуется привлечение искусственного  интеллекта. С другой стороны, такая обработка дает очень важные  результаты, которые вызывают не только академический интерес, но и имеют  сугубо практический характер.

 

Так, по результатам мониторинга уровня глюкозы в крови в течение нескольких суток были выявлены его провалы, которые происходят у ряда людей во время сна по определенным биологическим ритмам и даже могут повлечь внезапную смерть. Обладая такой информацией, врачи получают возможность купирования этой угрозы здоровью. И это только один из многих примеров тех возможностей, которые открываются перед медициной  вместе с развитием систем диагностики и мониторинга состояния разных систем организма.

 

Вопросу инструментария для работы с Big data (большими базами данных) в области биомедицины и тем возможностям, которые при этом открываются для диагностики и лечения заболеваний, будет посвящено несколько докладов на "Sbiomed-2018" -медицинском симпозиуме, проходящем в рамках BGRS-SP. 

На основе анализа данных (в том числе, косвенных), строится индивидуальная модель пульсовой кривой, для поиска среди ее характеристик различных биомаркеров.

 

"Основная наша цель: найти биомаркеры, которые характеризуют состояние  лимфатической системы и лимфотока в определенной части организма  пациента", - рассказал Андрей Летягин.

Эти параметры очень важны для выбора стратегии лечения такой патологии  как лимфедема. Она проявляется в нарушениях оттока жидкости по  лимфатическим сосудам, ведущим к нарастающим отекам мягких тканей пораженной области. Однако такие нарушения могут быть вызваны разными причинами и развиваться по разным механизмам, соответственно, и лечение их должно быть совершенно разным. В одном случае требуется физиотерапия, в другом - компрессионное бинтование, в третьем - воздействие на отдаленные лимфоузлы, в четвертом – затрагивать венозную систему.

 

Еще больше усложняют картину участие в развитии заболевания различных генетически обусловленных и внешних факторов. Распутать этот узел ученые рассчитывают с помощью разрабатываемой модели, где на основе найденных биомаркеров можно оценить происходящее на микроциркуляторном и клеточном уровнях. Зная механизм развития патологии в каждом конкретном случае, уже можно планировать индивидуализированную, правильную и наиболее эффективную стратегию лечения. Конечно, такая работа снова потребует обработки объемов информации, попадающих под определение Big data, а значит, в перспективе к ней надо будет привлекать системы искусственного интеллекта. А в результате, формируется та самая персонализированная медицина, о необходимотсти внедрения которой сегодня говорят повсеместно.

 

Напоминаем, что ведущие участники этого проекта примут участие в работе 11-й международной конференции по биоинформатике регуляции и структуры геномов  и  системной  биологии (Bioinformatics of Genome Regulation and Structure\Systems Biology - BGRS\SB-2018), которая пройдет в новосибирском Академгородке 20-25 августа 2018 года.

 

Георгий Батухтин.



 
По теме
Ученые Института теоретической и прикладной механики имени С. А. Христиановича СО РАН начали работу над созданием покрытий, которые будут отталкивать влагу и защищать самолёты от обледенения.
23.09.2018
На скамье подсудимых за хорошее знание науки и плохое – Уголовного кодекса оказался бывший сотрудник Института ядерной физики СО РАН: он добывал золото из раствора электролита, успел таким образом «намыть» 187 граммов.
23.09.2018
 
Площадкой для проведения областных соревнований стал бильярдный клуб «У Полковника», где студенты четырёх новосибирских вузов сразились в умении закатывать шары в лузы.
22.09.2018
Ученые Института теоретической и прикладной механики имени С. А. Христиановича СО РАН начали работу над созданием покрытий, которые будут отталкивать влагу и защищать самолёты от обледенения.
23.09.2018 РИА Сибирь
21 сентября Губернатор Новосибирской области посетил Сибирский государственный университет геосистем и технологий.
21.09.2018 49 канал Новосибирск
Новые технологические решения для проекта «Академгородок 2.0», использование цифровых платформ и BIM-технологий в развитии инфраструктуры Новосибирского научного центра, развитие цифровой экономики Новосибирской области,
21.09.2018 Сибирский репортер
Почему современным школьникам важно ориентироваться на рынке труда и всегда ли плохо, что в школе есть вторая смена?
20.09.2018 Газета Ведомости
В образе Буратино Алексей Толстой вывел великого русского поэта, убеждён историк литературы Валерий ШУБИНСКИЙ Жизнь писателя порой бывает настолько интересна сама по себе, что почитать о ней не менее интересно,
20.09.2018 Газета Ведомости
Консул Клаус Имме аккомпанировал себе на гитаре - НГС.Новости Консул Клаус Имме аккомпанировал себе на гитаре Консул Германии Клаус Имме выступил в необычной роли музыканта и певца — весь вечер он развлекал песнями публику,
23.09.2018 НГС.Новости
На площади перед Первомайским сквером водили хороводы и пели песни - НГС.Новости На площади перед Первомайским сквером водили хороводы и пели песни Сегодня в Первомайском сквере прошёл фестиваль славянской культуры «Родники» — желающим предложили различные славянские развлечения, а также мастер-классы.
23.09.2018 НГС.Новости
Полевая кухня настоящая, но неработающая. В «Потоке» она исполняет роль арт-объекта - НГС.Новости Полевая кухня настоящая, но неработающая. В «Потоке» она исполняет роль арт-объекта Лекторий-бар «Поток» в офисном комплексе «Сити Центр» вчера, 21 сентября, принял первых посетителей.
22.09.2018 НГС.Новости
Татьяна РЕШКЕ Фото Виктора Боровских Масштабный книжный форум собрал более 80 участников-экспонентов,
20.09.2018 Советская Сибирь
Писатель Андрей РУБАНОВ о новом реализме, «Патриоте» и Лимонове В этом году литературным хедлайнером фестиваля «Книжная Сибирь-2018» стал писатель Андрей Рубанов, считающий, что время постмодернизма уже в прошлом,
20.09.2018 Газета Ведомости
«Ведомости» побывали на уникальной выставке макетов архитектурных памятников Новосибирска и Санкт-Петербурга в ГПНТБ и узнали,
19.09.2018 Газета Ведомости
ПОЗДРАВЛЯЕМ! - БК Новосибирск Сегодня день рождения празднует тренер БК "Новосибирск", заслуженный тренер России Виктор Кухаренко.
23.09.2018 БК Новосибирск
Руководство отметило, что игроки находятся в плохой психологической форме и с этим надо бороться - НГС.Новости Руководство отметило, что игроки находятся в плохой психологической форме и с этим надо бороться Сегодня руководство ХК «Сибири» оценило прошедшие матчи и рассказало о дальнейшей стратегии — победы поможет достичь пос
23.09.2018 НГС.Новости
Как тысячи новосибирцев провели один из выходных — в фоторепортаже Валерия ПАНОВА   Не успел «отшуметь» Сибирский фестиваль бега,
18.09.2018 Газета Ведомости
Инна ВОЛОШИНА Фото с сайта nso.ru На Сахалине новосибирцы подтвердили высокий уровень подготовки профессиональных кадров в регионе Сборная Новосибирской области успешно выступила на чем­пионате «Молодые профессионалы».
19.09.2018 Советская Сибирь
Новосибирские легкоатлеты встретили «Золотую осень» на дистанции На лыжной базе имени Пелеганчука прошло открытое первенство города Новосибирска легкоатлетический кросс «Золотая осень» В мероприятии участвовало 164
19.09.2018 Газета Бумеранг
Матч 13-го тура Олимп-Первенства ФНЛ во Владивостоке между "Лучом" и "Сибирью" прошёл под проливным дождём на залитом водой поле и завершился поражением нашей команды с минимальным счётом 0:1.
23.09.2018 ФК Сибирь
На скамье подсудимых за хорошее знание науки и плохое – Уголовного кодекса оказался бывший сотрудник Института ядерной физики СО РАН: он добывал золото из раствора электролита, успел таким образом «намыть» 187 граммов.
23.09.2018 NSKTV.Ru