Ученые НГУ совместно с коллегами из Бельгии и Нидерландов идентифицировали 63 мультигенных модуля

Ученые НГУ совместно с коллегами из Бельгии и Нидерландов идентифицировали 63 мультигенных модуля
Фото: ria-sibir.ru

*                Есть результат




Воспалительное заболевание кишечника (Inflammatory bowel disease, IBD) представляет собой группу воспалительных состояний толстой кишки и тонкой кишки. Болезнь Крона и язвенный колит являются основными типами воспалительного заболевания кишечника. Еще в начале девятнадцатого столетия IBD было практически неизвестно. С тех пор число случаев этого заболевания (как и ряд других воспалительных заболеваний, включая астму) резко возросло в промышленно развитых обществах: в наши дни как минимум один человек из 500 страдает от IBD в какой-то момент своей жизни. Это явно указывает на ключевую роль экологических и (или) поведенческих факторов риска.

Однако не все люди одинаково чувствительны к этим факторам риска. Разница в предрасположенности к IBD в значительной степени определяется генетически. Это дало возможность использовать современные генетические подходы, которые в последнее время показали свою эффективность при расшифровке молекулярных основ возникновения заболеваний и для выявления новых лекарственных мишеней.

Полногеномные исследования ассоциации (GWAS) выявили более 200 регионов генома, которые лежат в основе различий в чувствительности к IBD1. Однако прежде, чем будет возможно использовать генетические данные, чтобы лучше понять болезнь и найти новые биомаркеры, необходимо найти функциональные гены и выдвинуть гипотезу об их механизме влияния на болезнь. К сожалению, функциональные варианты и гены могут быть с уверенностью определены лишь для небольшого количества локусов, что в целом характерно практически для всех сложных заболеваний.


Лаборатория теоретической и прикладной функциональной геномики факультета естественных наук Новосибирского госуниверситета сфокусировалась на так называемых пост-GWAS-исследованиях, которые позволяют связать найденный регион с биологической функцией. Результаты работы были опубликованы в престижном научном журнале Nature Communications в июне 2018 года.

При проведении этого исследования, возглавляемого профессором Мишелем Жоржем, ученые НГУ сотрудничали с учеными из Института GIGA в Университете Льежа (ULg) и компанией "ПолиОмика", объединив усилия по выявлению функциональных генов, связанных с риском развития IBD. Используя анализ cis-eQTL, искали гены, уровень экспрессии которых нарушен у людей с высоким риском возникновения IBD. Был создан уникальный набор данных CEDAR, включающий более 300 людей с информацией об экспрессии генов, расположенных в районе 200 известных IBD локусов, в девяти различных типах клеток. Применяя новейшие методы, были обнаружены 99 генов в 63 из 200 локусов риска IBD, которые, скорее всего, напрямую функционально связаны с IBD. Этот список представляет очень богатый источник потенциальных новых мишеней для разработки лекарств.

Как отметили в пресс-службе НГУ, чтобы поделиться полученными результатами с научным сообществом, был разработан веб-сайт CEDAR, который визуализирует полученные результаты.



 
По теме
Как записать ребенка в 1 класс? - Мошковский район С 1 апреля 2024 года начинается прием заявлений в 1 класс. Самый простой способ подать заявление – направить через портал Госуслуги.
Мошковский район
На благо избирателей - Газета Степная нива В ходе выездного совещания комитета Законодательного Собрания Новосибирской области по бюджетной, финансово-экономической политике и собственности депутаты работали в Карасукском, Купинском и Баганском районах.
Газета Степная нива
Разнообразие талантов - Газета Новосибирский район - территория развития В Доме детского творчества «Мастер» 22 марта состоялся предпоследний этап открытого конкурса «Ученик года».
Газета Новосибирский район - территория развития
Житель города Бердска предстанет перед судом по обвинению в убийстве родственника - Следственный комитет фото СУ СК РФ по Новосибирской области Следственным отделом по городу Бердск следственного управления Следственного комитета Российской Федерации по Новосибирской области завершено расследование уголовного дела в отно
Следственный комитет
Сначала анализ, потом — диагноз - Газета Степная нива С самого утра в кабинеты клинико-диагностической лаборатории центральной районной больницы стекаются пациенты с направлениями от всех врачей.
Газета Степная нива
Делаем всё возможное - ГБУЗ НСО ГНОКБ За два года, в течение которых на базе Новосибирской областной больницы работает детское онкологическое отделение, 11 маленьких пациентов прошли процедуру заместительной почечной терапии - гемодиализ.
ГБУЗ НСО ГНОКБ
Гайдар – для поколений - Тогучинская ЦБС 6 марта Юртовская сельская библиотека присоединилась к региональной акции «Аркадий Гайдар – для поколений», посвящённой 120–летию со дня рождения А. П. Гайдара и Году семьи.
Тогучинская ЦБС
Путешествие по пушкинским страницам - ЦБС Баганского района Двадцать девятого марта в Теренгульской сельской библиотеке состоялся увлекательный квизбук «Путешествие по пушкинским страницам».
ЦБС Баганского района